醫(yī)療體系在自閉兒鑒定的實(shí)施中沒有一致的流程與規(guī)范，但是教育體系由學(xué)校內(nèi)輔導(dǎo)室負(fù)責(zé)統(tǒng)整特殊兒童的發(fā)現(xiàn)、篩選，以及各縣市政府‘特殊學(xué)生鑒定、安置及就學(xué)輔導(dǎo)委員會(huì)’（簡(jiǎn)稱鑒輔會(huì)）統(tǒng)籌整體鑒定、安置等相關(guān)事項(xiàng)，因此，鑒定流程包括發(fā)現(xiàn)、篩選及鑒定三階段：
‘發(fā)現(xiàn)階段’中，由于自閉兒的癥狀常于嬰幼兒期就出現(xiàn)，***晚也在三歲以前出現(xiàn)。父母或其他主要照顧者透過平時(shí)互動(dòng)與觀察，由孩子與同儕比較中發(fā)現(xiàn)口語(yǔ)或非口語(yǔ)溝通的遲緩、視線接觸少、情感理解與表達(dá)、行為模式及興趣缺乏變化等現(xiàn)象，則可到教學(xué)醫(yī)院接受鑒定，或年齡三歲以上時(shí)，向?qū)W校鑒定小組提出鑒定的申請(qǐng)。
‘篩選階段’主要在過濾疑似自閉兒的個(gè)案，以便進(jìn)行進(jìn)一步的鑒定工作?？捎舍t(yī)生或?qū)W校鑒定小組實(shí)施簡(jiǎn)易的篩選工作，如‘克氏行為量表’、‘自閉癥兒童篩選量表’等工具篩選出疑似個(gè)案，而后進(jìn)一步到醫(yī)院接受鑒定、或透過學(xué)校向縣市鑒輔會(huì)提出申請(qǐng)。
‘鑒定階段’中，已鑒定或領(lǐng)有自閉癥手冊(cè)的孩子不需再接受鑒定，而是評(píng)估能力現(xiàn)況；未鑒定或領(lǐng)有非自閉癥手冊(cè)而有疑義的孩子，鑒輔會(huì)應(yīng)安排適當(dāng)?shù)男睦碓u(píng)量教師進(jìn)行評(píng)量或安排至適當(dāng)?shù)尼t(yī)院鑒定，以確認(rèn)是否為自閉兒。